Le Doubs est en zone climatique H1c. Dans ce département, l’altitude fait vite varier le calcul : la RE2020 classe les projets en trois tranches, moins de 400 m, de 400 à 800 m et plus de 800 m, et adapte le climat de calcul et les plafonds de Bbio et de Cep à chacune.
Le centre historique, dans la boucle du Doubs, est à environ 250 m, et la commune monte jusqu’à 605 m : selon le quartier, un terrain bisontin relève de la première ou de la deuxième classe. À Pontarlier, toute la commune est au-dessus de 800 m : un projet y passe dans la troisième.
Besançon a un climat semi-continental, selon le classement de Météo-France : hivers rigoureux, pluie en toutes saisons (environ 1 160 mm par an sur 1991-2020) et ensoleillement médiocre. Ce dernier point compte : l’hiver, les fenêtres récupèrent moins de soleil qu’ailleurs, et c’est l’enveloppe qui doit faire le travail.
